Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb5O70309 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms