Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Foxq1O70220 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Foxq1O70220 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Foxq1O70220 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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