Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna4O70174 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrna4O70174 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms