Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3aO70157 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3aO70157 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3aO70157 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Top3aO70157 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3aO70157 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3aO70157 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3aO70157 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Top3aO70157 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms