Protein–RNA interactions for Protein: O55192

Slc6a2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a2O55192 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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Slc6a2O55192 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Slc6a2O55192 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Slc6a2O55192 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc6a2O55192 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms