Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyp26a1O55127 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp26a1O55127 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp26a1O55127 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp26a1O55127 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp26a1O55127 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp26a1O55127 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp26a1O55127 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyp26a1O55127 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26a1O55127 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26a1O55127 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26a1O55127 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26a1O55127 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26a1O55127 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26a1O55127 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26a1O55127 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26a1O55127 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26a1O55127 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26a1O55127 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26a1O55127 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26a1O55127 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26a1O55127 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26a1O55127 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26a1O55127 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26a1O55127 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26a1O55127 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26a1O55127 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyp26a1O55127 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms