Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc3O55013 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms