Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LatO54957 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LatO54957 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LatO54957 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LatO54957 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LatO54957 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LatO54957 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LatO54957 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LatO54957 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LatO54957 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LatO54957 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LatO54957 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LatO54957 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LatO54957 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LatO54957 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LatO54957 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LatO54957 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LatO54957 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LatO54957 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LatO54957 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LatO54957 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LatO54957 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LatO54957 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LatO54957 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LatO54957 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LatO54957 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LatO54957 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LatO54957 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LatO54957 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LatO54957 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LatO54957 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LatO54957 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LatO54957 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LatO54957 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LatO54957 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LatO54957 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LatO54957 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LatO54957 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LatO54957 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LatO54957 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LatO54957 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LatO54957 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms