Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema6bO54951 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema6bO54951 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms