Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdh16O54909 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms