Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3O54890 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms