Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbrO54799 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbrO54799 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbrO54799 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NmbrO54799 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms