Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DffaO54786 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DffaO54786 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DffaO54786 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DffaO54786 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DffaO54786 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DffaO54786 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DffaO54786 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DffaO54786 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DffaO54786 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DffaO54786 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DffaO54786 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DffaO54786 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DffaO54786 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DffaO54786 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DffaO54786 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DffaO54786 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DffaO54786 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DffaO54786 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DffaO54786 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DffaO54786 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DffaO54786 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DffaO54786 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DffaO54786 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DffaO54786 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DffaO54786 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DffaO54786 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DffaO54786 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DffaO54786 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DffaO54786 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DffaO54786 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DffaO54786 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DffaO54786 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DffaO54786 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DffaO54786 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffaO54786 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffaO54786 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffaO54786 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffaO54786 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffaO54786 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffaO54786 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffaO54786 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffaO54786 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffaO54786 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffaO54786 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffaO54786 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffaO54786 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DffaO54786 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DffaO54786 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffaO54786 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffaO54786 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffaO54786 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffaO54786 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffaO54786 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DffaO54786 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffaO54786 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffaO54786 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffaO54786 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffaO54786 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffaO54786 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffaO54786 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffaO54786 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffaO54786 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DffaO54786 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffaO54786 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffaO54786 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffaO54786 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffaO54786 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffaO54786 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffaO54786 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DffaO54786 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms