Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gp1baO35930 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms