Protein–RNA interactions for Protein: O35912

Emp3, Epithelial membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp3O35912 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Emp3O35912 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emp3O35912 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emp3O35912 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emp3O35912 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Emp3O35912 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms