Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CaluO35887 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CaluO35887 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CaluO35887 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CaluO35887 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CaluO35887 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CaluO35887 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CaluO35887 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CaluO35887 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CaluO35887 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CaluO35887 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CaluO35887 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CaluO35887 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CaluO35887 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CaluO35887 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CaluO35887 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CaluO35887 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CaluO35887 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CaluO35887 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CaluO35887 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CaluO35887 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CaluO35887 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CaluO35887 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CaluO35887 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CaluO35887 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CaluO35887 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CaluO35887 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CaluO35887 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CaluO35887 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CaluO35887 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CaluO35887 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CaluO35887 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CaluO35887 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CaluO35887 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CaluO35887 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CaluO35887 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CaluO35887 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CaluO35887 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CaluO35887 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CaluO35887 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CaluO35887 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CaluO35887 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CaluO35887 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CaluO35887 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CaluO35887 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CaluO35887 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CaluO35887 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CaluO35887 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CaluO35887 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CaluO35887 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CaluO35887 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CaluO35887 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CaluO35887 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CaluO35887 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CaluO35887 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CaluO35887 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CaluO35887 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CaluO35887 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CaluO35887 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CaluO35887 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CaluO35887 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CaluO35887 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CaluO35887 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CaluO35887 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CaluO35887 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CaluO35887 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CaluO35887 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CaluO35887 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CaluO35887 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CaluO35887 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms