Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Phox2bO35690 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Phox2bO35690 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Phox2bO35690 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Phox2bO35690 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Phox2bO35690 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Phox2bO35690 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Phox2bO35690 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Phox2bO35690 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms