Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx8O35652 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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