Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn6O35646 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn6O35646 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn6O35646 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn6O35646 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn6O35646 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn6O35646 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn6O35646 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn6O35646 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn6O35646 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn6O35646 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn6O35646 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Capn6O35646 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn6O35646 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn6O35646 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn6O35646 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn6O35646 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn6O35646 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms