Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk4O35493 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clk4O35493 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk4O35493 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Clk4O35493 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk4O35493 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Clk4O35493 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Clk4O35493 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk4O35493 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clk4O35493 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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