Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Edil3O35474 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edil3O35474 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edil3O35474 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edil3O35474 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edil3O35474 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edil3O35474 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edil3O35474 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edil3O35474 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Edil3O35474 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms