Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TnxbO35452 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TnxbO35452 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TnxbO35452 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TnxbO35452 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TnxbO35452 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TnxbO35452 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms