Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Prrt1O35449 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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