Protein–RNA interactions for Protein: O35405

Pld3, Phospholipase D3, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld3O35405 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Pld3O35405 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Pld3O35405 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Pld3O35405 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Pld3O35405 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Pld3O35405 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pld3O35405 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pld3O35405 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pld3O35405 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pld3O35405 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pld3O35405 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pld3O35405 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pld3O35405 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pld3O35405 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pld3O35405 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pld3O35405 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pld3O35405 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pld3O35405 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pld3O35405 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pld3O35405 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pld3O35405 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pld3O35405 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pld3O35405 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pld3O35405 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms