Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Srsf5O35326 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Srsf5O35326 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms