Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad6O35182 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad6O35182 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad6O35182 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad6O35182 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad6O35182 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad6O35182 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad6O35182 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms