Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pitx3O35160 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms