Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr1aO35134 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr1aO35134 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms