Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ArxO35085 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArxO35085 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArxO35085 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArxO35085 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArxO35085 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArxO35085 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArxO35085 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArxO35085 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArxO35085 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArxO35085 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArxO35085 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ArxO35085 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArxO35085 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArxO35085 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArxO35085 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArxO35085 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArxO35085 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArxO35085 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArxO35085 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArxO35085 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArxO35085 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArxO35085 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArxO35085 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArxO35085 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArxO35085 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArxO35085 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ArxO35085 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ArxO35085 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ArxO35085 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ArxO35085 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ArxO35085 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ArxO35085 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ArxO35085 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ArxO35085 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ArxO35085 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ArxO35085 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ArxO35085 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ArxO35085 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ArxO35085 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ArxO35085 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ArxO35085 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ArxO35085 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ArxO35085 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ArxO35085 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ArxO35085 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ArxO35085 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ArxO35085 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ArxO35085 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ArxO35085 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ArxO35085 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ArxO35085 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ArxO35085 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ArxO35085 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ArxO35085 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ArxO35085 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ArxO35085 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ArxO35085 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ArxO35085 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ArxO35085 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ArxO35085 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ArxO35085 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArxO35085 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArxO35085 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArxO35085 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArxO35085 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArxO35085 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ArxO35085 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArxO35085 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArxO35085 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArxO35085 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ArxO35085 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms