Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Casq1O09165 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Casq1O09165 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Casq1O09165 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casq1O09165 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casq1O09165 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casq1O09165 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Casq1O09165 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Casq1O09165 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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