Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps1O08983 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps1O08983 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps1O08983 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps1O08983 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps1O08983 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hps1O08983 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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