Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EllO08856 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EllO08856 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EllO08856 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EllO08856 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EllO08856 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
EllO08856 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EllO08856 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EllO08856 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EllO08856 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EllO08856 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EllO08856 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EllO08856 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EllO08856 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EllO08856 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EllO08856 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EllO08856 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EllO08856 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EllO08856 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EllO08856 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EllO08856 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EllO08856 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EllO08856 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EllO08856 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EllO08856 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EllO08856 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EllO08856 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EllO08856 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EllO08856 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EllO08856 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EllO08856 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EllO08856 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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EllO08856 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EllO08856 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EllO08856 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EllO08856 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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EllO08856 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EllO08856 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EllO08856 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EllO08856 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
EllO08856 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EllO08856 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EllO08856 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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EllO08856 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EllO08856 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EllO08856 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EllO08856 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EllO08856 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EllO08856 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EllO08856 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EllO08856 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EllO08856 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EllO08856 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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EllO08856 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EllO08856 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EllO08856 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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EllO08856 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EllO08856 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EllO08856 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EllO08856 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EllO08856 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EllO08856 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EllO08856 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EllO08856 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EllO08856 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EllO08856 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EllO08856 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EllO08856 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EllO08856 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EllO08856 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EllO08856 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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