Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra2O08842 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms