Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eftud2O08810 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eftud2O08810 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms