Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MttpO08601 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MttpO08601 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MttpO08601 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MttpO08601 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MttpO08601 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MttpO08601 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MttpO08601 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MttpO08601 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MttpO08601 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MttpO08601 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MttpO08601 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MttpO08601 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MttpO08601 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MttpO08601 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MttpO08601 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
MttpO08601 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MttpO08601 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MttpO08601 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MttpO08601 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MttpO08601 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MttpO08601 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MttpO08601 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MttpO08601 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MttpO08601 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MttpO08601 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MttpO08601 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MttpO08601 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MttpO08601 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MttpO08601 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MttpO08601 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MttpO08601 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MttpO08601 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MttpO08601 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MttpO08601 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MttpO08601 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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MttpO08601 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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MttpO08601 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MttpO08601 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MttpO08601 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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MttpO08601 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MttpO08601 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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MttpO08601 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MttpO08601 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MttpO08601 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MttpO08601 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MttpO08601 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MttpO08601 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MttpO08601 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MttpO08601 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MttpO08601 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MttpO08601 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MttpO08601 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MttpO08601 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MttpO08601 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MttpO08601 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MttpO08601 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MttpO08601 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MttpO08601 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MttpO08601 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MttpO08601 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MttpO08601 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MttpO08601 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MttpO08601 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms