Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20939L7N243 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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