Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm2888K7N746 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm2888K7N746 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms