Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3542K7N6U2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3542K7N6U2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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