Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm2056J3QQ02 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm2056J3QQ02 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gm2056J3QQ02 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm2056J3QQ02 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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