Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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