Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top6blJ3QMY9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top6blJ3QMY9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms