Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm3727J3QM54 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm3727J3QM54 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm3727J3QM54 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm3727J3QM54 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm3727J3QM54 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm3727J3QM54 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm3727J3QM54 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm3727J3QM54 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Gm3727J3QM54 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3727J3QM54 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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