Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21818J3KMS6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms