Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Gm21897J3KMP5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21897J3KMP5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Gm21897J3KMP5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Gm21897J3KMP5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Gm21897J3KMP5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21897J3KMP5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm21897J3KMP5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21897J3KMP5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21897J3KMP5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21897J3KMP5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21897J3KMP5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm21897J3KMP5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm21897J3KMP5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm21897J3KMP5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Gm21897J3KMP5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm21897J3KMP5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21897J3KMP5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm21897J3KMP5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21897J3KMP5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm21897J3KMP5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21897J3KMP5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21897J3KMP5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21897J3KMP5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21897J3KMP5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21897J3KMP5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21897J3KMP5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21897J3KMP5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Gm21897J3KMP5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21897J3KMP5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21897J3KMP5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm21897J3KMP5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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