Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20830J3KML6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20830J3KML6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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