Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pot1bH7BX60 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms