Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm29394H3BIW7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm29394H3BIW7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms