Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pcf11G3X9Z4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcf11G3X9Z4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms