Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arfgef1G3X9K3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arfgef1G3X9K3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms