Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zc3h12bG3X9I7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms